A kolozsvári szászok által 1545-ben alapított iskola (→iskolahálózat 2.b) könyvtárának 16. sz.-i történetéről nem maradt fenn forrás. A 17. sz. második felétől azonban viszonylag jól nyomon követhető a könyvtár szellemiségének alakulása. Az 1656-tól vezetett Apácai-albumban megőrződött, 1668 k. keletkezett katalógusból már halványan kivehető a később markánssá váló szellemi irányvonal. Ezt az irányultságot →Apácai Csere János adta a kollégiumnak, s ennek köszönhetően a 17. sz. második felétől a legmodernebb teológiai áramlatok is képviseltették magukat a bibliotékában. Az 1692–96-os, Kurtány József-féle és a Visky János által írt 1704-es állományjegyzék szintén megerősíti ezt a megállapítást. Az 1752-es katalógusból már egy olyan gyűjtemény tárul elénk, amely a debrecenivel vagy a sárospatakival nagyságban is összevethető. Mindez természetesen nem jöhetett volna létre a számtalan adomány nélkül, amelyet főként a peregrinus diákok (Krizbai György, Bátai György, Rozgonyi Pastoris János, Jenei István stb.) hagyományoztak az alma mater könyvtárára.